replace msleep() by thread signalling in comms.c

uart_posix.c rework
* added some LED handling in appmain.c (helped with debugging)
* finally replaced the infamous device unlink by msleep(1000)
* fixed some format strings in comms.c (with -DCOMMS_DEBUG)
* made uart_receive() and uart_send() behave as described in header
* some formating

cleaning up uart_posix.c
* whitespace fixes
* sorting out #includes

Add missing includes

Always enable fast response mode (was enabled for flasher only)
* ensure that CMD_ACK is used exclusively for the very last response of each PM3 operation. All Dbprintf() must be before.
* always switch off field before exiting
* append null packet for USB transfers % 64 bytes
* reformatting and whitespace fixes

modify USB communications
* use different data types for commands and responses
* use variable length responses
* maintain client/flasher compatibility with old format (e.g. when using old bootloader)
* maintain bootloader compatibility with old format (e.g. when using old or RRG flasher.exe)
* fix length of version string in appmain.c

usb communication (device side) refactoring
* merge cmd.c into usb_cdc.c
* move back usb_cdc.[ch] to common/
* declare low level functions usb_read() and usb_write() and more functions as static
* use cmd_receive() in bootrom.c and appmain.c
* remove unused memory wasting csrTab[100] in usb_cdc.c
* replace more byte_t by uint8_t
* more whitespace fixes

usb communication (device side) housekeeping
* move cmd.[ch] and usb_cdc.[ch] to armsrc
* sorting out #includes
* replace byte_t by uint8_t
* some reformatting
* whitespace fixes
* (no functional changes)

Merge pull request #909 from pwpiwi/fix_button_break

Fix "Sending bytes to proxmark failed" with BUTTON_PRESS()

fix "Sending bytes to proxmark failed" after BUTTON_PRESS()

appmain.c cleanup
* reformatting
* whitespace fixes
* replace byte_t by uint8_t

speedup 'hf mf chk' (#901)

* add separate timeout for tag response to nr_ar
* measure response time and use it for response timeout
* don't drop field between keyblocks
* some reformatting
* some whitespace fixes
* fishing for microseconds in TransmitFor14443a()
* allow arbitrary number of keys in MifareChkKeys()
* and move progress printing to MifareChkKeys()

Co-authored-by: uzlonewolf <github_com@hacker-nin.com>

fix hf search (#908)

* fix memory access violation in HF14B_Other_Reader()

fix gcc8 compiler warnings on string overflows (#905)

fix 'hf iclass writebl' and 'hf iclass clone' (#896)

* check for correct responses after block updates
* reduce number of tries from 10 to 3
* Allow to override warning on attempt to clone blocks < 5
* add same warning and override option to 'hf iclass writebl'
* some reformatting and minor refactoring
* Drop field after dump and clone functions
* If dumping AA1 with Credit Key, authenticate as Debit Key
* Initialize reader when beginning to clone

"hf mf ekeyprn d" doesn't works properly (#904)

FIX: command "hf mf ekeyprn  d" doesn't use the correct offset to locate the A key in data[] array and record the 2 last bytes followed by 4 0x00 instead of the 6 good bytes (All the A keys are corrupted in file dumpkeys.bin). B keys are not affected.

Nested loop fix for static nonces

* add detection of static tag nonces
* add tag nonce to error message
* modify mfCheckKeys() to pass button press events upstream
* don't abort nested when a static nonce is encountered
* modify nested to try multiple keys in a single operation
* Print keys remaining only every 10 seconds, and add estimated worst-case time

fix 'hf 15 csetuid' (#890)

* fix 'hf 15 csetuid'
* check for error codes, prevent client crash
* some include file refactoring
* some whitespace fixes
* allow longer timeout for write commands
* add function to send EOF only
* modify 'hf list 15' to display "<EOF>"
* add tracing of Reader commands
* if REQ_OPTION is set on write commands, send separate EOF to request tag response
* use #defines instead of hex constants
* switch off field after UID update
* return last tag response (if there is any)
* iso15693: decode WRITE_MULTI_BLOCK in 'hf list 15'

fix 'hf iclass chk' (#894)

* Check for Credidt Keys as well
* reduce authentication tries from 6 to 3
* correct text in 'hf iclass clone' for 'l' parameter
* some reformatting and whitespace fixes

Bugfix: Output typing on print of HID card formats (#895)

* Bugfix: Output typing on print of HID card formats

The 'PrintAndLog' calls were using signed types and sometimes too few bits in width for formatting/outputting the data as was revealed in the forums. This commit will correct the printf-formatted output typing on display of the fields.

* Update hidcardformats.c

Updated to use macros as requested by @pwpiwi

fix 'hf iclass replay' (#888)

* implement option -n for authentication with replayed NR/MAC pairs in 'dump' and 'readbl'
* delete 'hf iclass replay'

Hitag fixes (#887)

* don't display error message during 'lf search' when no Hitag tag is present
* remove superfluous options in 'lf hitag read'
* fix setting of default threshold when selecting FPGA_CMD_SET_EDGE_DETECT_THRESHOLD major mode
* some refactoring

Merge pull request #884 from pwpiwi/fix_iclass_snoop

* determine and write meaningful times into trace
* code deduplication: use ISO15693 snoop function
* speed up SnoopIso15693(), reduce DMA buffer size
* add jamming option '-j' to 'hf iclass snoop'
* fix issue #882
* whitespace fixes
* make room for one more bit for FPGA minor mode
* new mode FPGA_HF_READER_MODE_SEND_JAM
* implement jamming in Handle15693SampleFromReader

implement 'hf iclass snoop -j'
* fix long option --jam
* make room for one more bit for FPGA minor mode
* new mode FPGA_HF_READER_MODE_SEND_JAM
* implement jamming in Handle15693SampleFromReader

fix 'hf iclass snoop'
* code deduplication: use ISO15693 snoop function
* speed up SnoopIso15693(), reduce DMA buffer size
* add jamming option '-j' to 'hf iclass snoop'
* fix issue #882
* whitespace fixes

fix 'hf iclass snoop'
* 'hf 15 snoop': determine and write meaningful times into trace

mod 'hf list' (#881)

* switch to argtable command line parsing (i.e. options must now be preceded by '-')
* add option '-r' to display relative times
* add option '-u' to display times in microseconds
* fix: graceful exit if trace is requested from offline PM3

fix 'hf iclass' (#879)

* add loooong timeout for UPDATE command
* add flags FLAG_ICLASS_READER_INIT and FLAG_ICLASS_READER_CLEARTRACE
* don't overwrite trace buffer during 'hf iclass dump'
* fix long waiting time when start_time==0 in TransmitTo15693Tag()
* remove some additional debug prints
* refactoring: move helper functions from protocols.c to cmdhficlass.c
* add 'h' and '1' options to 'hf iclass reader' (from RRG repository)
* use correct key when only CreditKey is given in 'hf iclass dump'
* separate select_and_auth
* DropField() on errors
* dump last block in 'hf iclass dump'
* display correct memory size (number of blocks) in 'hf iclass reader' and dump
* more whitespace fixes

fix 'hf 14b sriwrite' (#880)

Merge pull request #876 from pwpiwi/fix_iclass_reader

fix 'hf iclass reader'
* code deduplication. Use functions from iso15693.c
* speedup CodeIso15693AsReader()
* invert reader command coding. 0 now means 'unmodulated' ( = field on)
* decode SOF only as a valid tag response in Handle15693SamplesFromTag()
* complete decoding of EOF in Handle15693SamplesFromTag()
* determine and write correct times to trace
* FPGA-change: generate shorter frame signal to allow proper sync in StartCountSspClk()
* modify StartCountSspClk() for 16bit SSC transfers
* whitespace in util.c
* add specific LogTrace_ISO15693() with scaled down duration. Modify cmdhflist.c accordingly.
* allow 'hf 15 raw' with single byte commands
* check for buffer overflow, card timeout and single SOF in 'hf 15 raw'
* decode and handle SOF only responses in Handle14443bSamplesDemod()
* allow 1 byte commands with 'hf 14b raw'
* don't do READCHECK when not trying to authenticate
* standard LED handling
* remove unused FLAG_ICLASS_READER_ONLY_ONCE and FLAG_ICLASS_READER_ONE_TRY
* sanity check for negative times in TransmitTo15693Tag()
* increase reader timeout for 'hf 15' functions to be enough for slot 7 answers to ACTALL
* add 'hf iclass permute' inspired by RRG repository
* whitespace in cmdhficlass.c

fix 'hf iclass reader' and 'hf iclass readblk'
* don't do READCHECK when not trying to authenticate
* standard LED handling
* remove unused FLAG_ICLASS_READER_ONLY_ONCE and FLAG_ICLASS_READER_ONE_TRY
* sanity check for negative times in TransmitTo15693Tag()
* increase reader timeout for 'hf 15' functions to be enough for slot 7 answers to ACTALL
* add 'hf iclass permute' inspired by RRG repository
* whitespace fixes

iso14443b: trying to approach iClass
* decode and handle SOF only responses in Handle14443bSamplesDemod()
* allow 1 byte commands with 'hf 14b raw'

'hf 14b' formatting
* renaming a few functions
* whitespace
* moving a bit towards RRG repo

fix 'hf iclass reader'
* code deduplication. Use functions from iso15693.c
* speedup CodeIso15693AsReader()
* invert reader command coding. 0 now means 'unmodulated' ( = field on)
* decode SOF only as a valid tag response in Handle15693SamplesFromTag()
* complete decoding of EOF in Handle15693SamplesFromTag()
* determine and write correct times to trace
* FPGA-change: generate shorter frame signal to allow proper sync in StartCountSspClk()
* modify StartCountSspClk() for 16bit SSC transfers
* whitespace in util.c
* add specific LogTrace_ISO15693() with scaled down duration. Modify cmdhflist.c accordingly.
* allow 'hf 15 raw' with single byte commands
* check for buffer overflow, card timeout and single SOF in 'hf 15 raw'

Merge pull request #862 from pwpiwi/fix_iclass_sim

fix hf iclass sim:
* sim 2: add responses to read(1) (Config) and read(5) (AIA)
* sim 2/3: don't restrict CC to 00 bytes only
* sim 3: add responding to read block commands
* sim 2/3: add responding to READ_CHECK_KC
* fix sizes of pre-encoded tag answers
* sim 2: change default card challenge
* remove commented code
* use #defines instead of numerical constants for simulation modes
* some reformatting and whitespace fixes
* fix debug print on unhandled commands
* deduplicate: use sim functions from iso15693.c
* fix times in tracelog and 'hf list iclass' (sim only)
* don't check parity in 'hf list iclass'
* fix timing in TransmitTo15693Reader()
* add simulation of block 3 and 4 (Kd and Kc) reads
* add simulation of READ4 (4 blocks read)
* FPGA change (hi_simulate.v): avoid spp_clk phase changes
* chg to reader command decoder in iso15693.c (require no modulation before SOF)
* add 'has_been_low_for' logic to hi_simulate.v (same as in other FPGA modes, default to "no modulation")
* add simulation of chip status (IDLE, ACTIVE, SELECTED, HALTED)
* check ACSN on SELECT
* add simulation of RESELECT
* always check length of reader commands
* fix printing of NR, MAC in sim 2 mode
* fix response length to CHECK command
* implement UPDATE and CHECK[Kc]
* add simulation of multiple pages (PAGESEL by @sherhannn9)
* maintain cipher states per page
* update cipher state after UPDATE commands (@sherhannn9)
* add simulation of personalization mode
* respond with SOF on HALT
* display "\<SOF\>" instead of "0f" in 'hf list iclass'
* standard LED handling
* speedup CodeIso15693AsTag()
* TransmitTo15693Tag(): don't send unmodulated start of SOF
* reduce modulation depth in hi_simulate.v

Merge pull request #873 from quantum-x/patch-2

Update README.md

Update README.md

Updated as per PR discussion thead

Update README.md

Updated reference to Lab401 as an EU reseller, not a HK reseller.

Merge branch 'master' into fix_iclass_sim

fix iclass reader functions

* remove unused CMD_ICLASS_READCHECK
* fix wrong command coding in CodeIClassCommand()
* switch field off at end of commands to avoid RDV4 overheating

fix 'hf iclass sim'
* fix tag response timing. iClass differs from ISO15693 in this respect.
* speedup CodeIso15693AsTag()
* TransmitTo15693Tag(): don't send unmodulated start of SOF
* reduce modulation depth in hi_simulate.v
* calculate CRC for configuration block when simulating
* Show real response time instead of planned response time in 'hf list iclass'

fix 'hf iclass sim'
* add simulation of multiple pages (PAGESEL by @sherhannn9)
* maintain cipher states per page
* update cipher state after UPDATE commands (@sherhannn9)
* add simulation of personalization mode
* respond with SOF on HALT
* display "<SOF>" instead of "0f" in 'hf list iclass'
* standard LED handling

fix 'hf iclass eload' (thanks to @sherhannn79)

fix 'hf iclass sim':
* implement CHECK[Kc] based on @sherhannn79
* implement UPDATE based on @sherhannn79

fix 'hf iclass sim':
* ignore standard iso15693 INVENTORY commands silently
* make iso15693 command decoder more strict (prevent decoding rubbish)
* re-enable sim 3

Merge branch 'master' into fix_iclass_sim

fix 'hf iclass sim':
* chg to reader command decoder in iso15693.c (require no modulation before SOF)
* add 'has_been_low_for' logic to hi_simulate.v (same as in other FPGA modes, default to "no modulation")
* add simulation of chip status (IDLE, ACTIVE, SELECTED, HALTED)
* check ACSN on SELECT
* add simulation of RESELECT
* always check length of reader commands
* fix printing of NR, MAC in sim 2 mode
* fix response length to CHECK command

fix compile issue with gcc 9.1.0 (issue #868)

'hf iclass loclass': fix error handling (#865)

* fix handling of "BEING_CRACKED" flag
* don't try to calculate KCus when some bytes couldn't be brute forced
* whitespace fixes

fix 'hf iclass sim':
* add simulation of block 3 and 4 reads
* add simulation of READ4 (4 blocks read)
* fixing TransmitTo15693Reader()  (again)
* FPGA change (hi_simulate.v): avoid spp_clk phase changes
* some whitespace fixes

fix 'hf iclass sim'
* fix debug print on unhandled commands
* deduplicate: use sim functions from iso15693.c
* fix times in tracelog and 'hf list iclass' (sim only)
* don't check parity in 'hf list iclass'
* fix timing in TransmitTo15693Reader()

fix hf iclass sim
* sim 2: add responses to read(1) (Config) and read(5) (AIA)
* sim 2/3: don't restrict CC to 00 bytes only
* sim 3: add responding to read block commands
* sim 2/3: add responding to READ_CHECK_KC
* fix sizes of pre-encoded tag answers
* change default card challenge
* remove commented code
* use #defines instead of numerical constants for simulation modes
* some reformatting

Merge pull request #861 from pwpiwi/iclass_MAC_speedup

iClass MAC calculation speedup (optimized_cipher.c)

add iclass.h

Merge branch 'master' into iclass_MAC_speedup

iclass.c: speeding up MAC calculation

'lf hitag writer': add Hitag2 password auth

* (PRs 233, 303, 304 by @ViRb3 on https://github.com/RfidResearchGroup/proxmark3)
* replace byte_t by uint8_t
* note that Hitag1 commands are not yet available
* whitespace fixes
* #define Hitag2 commands
* whitespace
* add EOF wait time
* add powerup wait time

add: 'hf mf personalize' (personalize UID on Mifare Classic EV1 7byte UID cards)

* add/use some #defines
* whitespace fixes
* #include refactoring
* add line to CHANGELOG.md

PCF7931: Print found single/consecutive block(s), fixes to block 1 check

cleaning up iclass.c and optimized_cipher.c
* add iclass.h
* reformatting
* whitespace fixes
* (no functional changes)

chg 'hf mf chk':

* don't repeatedly clear trace while running (PR 243 by @mceloff from https://github.com/RfidResearchGroup/proxmark3)
* standard LED handling
* better check for key file syntax
* get rid of "res" column when printing the result. Show unknown keys more prominent as "     ?     "

'hf 14a apdu' improvement

(PR 249 by @merlokk on https://github.com/RfidResearchGroup/proxmark3)
* add option to print APDU (if it can be decoded)
* add option to cconstruct extended and normal size APDUs

fix emv search behavior

(taken from PRs 261 and 262 by @merlokk on https://github.com/RfidResearchGroup/proxmark3)
+ whitespace fixes

fix 'hf mf sim': access conditions to write Key B were not decoded correctly

(from PR 279 https://github.com/RfidResearchGroup/proxmark3)

Implement Originality Signature Check in 'hf mfu info'

* add support for elliptic curve 'secp128r1' to mbedtls library
* change ecdsa_signature_verify() to allow different curves, signature lengths, and skipping hash
* add another public key for Mifare Ultralight EV1

Fix Issue #843 - hf mf chk - t Doesnt save to emulator memory

Add 'hf 15 csetuid' command to set UID on ISO15693 Magic tags (#842)

update em4x05 timing (#846)

See @mwalker33 issue #838

Merge pull request #837 from mwalker33/master

lf t55xx downlink modes support added

whitespace cleaning

Update lfops.c

boundary length check

Update lfops.c

Fixed lf t55 reset

Code tidy

removed commented code

Update lfops.c

moved wakeup and reset to call T55xx_SendCMD.  Small code improvements

Code improved for less memory

Update CHANGELOG.md

Update CHANGELOG.md

Resolved Conflicts

Update lfops.c

Merge branch 'master' into master

Update lfops.c

Update CHANGELOG.md

Update CHANGELOG.md

Change Log Update

add lf em 4x05protect plus lf config s option (#833)

* add "samples to skip" for lf config (mainly for lf snoop)
* add lf em 4x05protect command to write protection on em4x05 chips
* fix spacing
* and remove old comment git added back in..
* update changelog
* fix flags - only need 1 bit

T55xx Downlink - Updates

Improved code.

Cleanup Code

Update downlink option from e to r
fixed long leading reference
added downling option to original bruteforce

Update cmdlft55xx.c

Fixed bruteforce filename

Update cmdlft55xx.c

Minor Cleanup

T55xx downlink Modes

Changes :
- Added t55xx downlink protocols (long leading reference, leading 0 and 1 of 4)
- Added function to all read to call differnet downlink functions (to match write)
- Update functions to support using differnet downlink modes.
- Added support for calling downlink modes for lf t55 read, write and detect
- Added new function lf t55 bruteforcedl to support downlink modes as well as try each mode
for each password in password file.

for functions with downlink mode extenstion.

 e <mode>     - OPTIONAL downlink encoding '0' fixed-bit-length (default),
   '1' Long Zero Reference,
   '2' Leading Zero,
   '3' 1 of 4

upgrading 'hf mfu' (#830)

* chg: write new dump file format by @mceloff
* chg: rename 'hf mfu dump' option 'n' to 'f' to align with other commands and RRG repo
* chg: replace ISO14443A_CMD_READBLOCK by MIFARE_CMD_READBLOCK, same for WRITEBLOCK
* fix: mifare_ultra_readblock() returned 14 bytes instead of 16
* chg: param_gethex_ex() now checks maximum output buffer length
* chg: ul_comp_write() was incomplete and for magic testing only
* fix: 16bit ULC counter had been displayed as 32bit
* chg: add check for 7 Byte UID, drop check for ATQA in type identification GetHF14AMfU_Type()
* fix: send HALT instead of dropping field in order to maintain a defined state
* chg: DropField() when command ends
* chg: check for invalid page ranges in 'hf mfu dump'
* fix: print correct lock bits when page range is used
* fix: do not write (incomplete) dumpfile when page range is used
* add: use UID for filename when no filename is given (RRG repo)
* chg: don't clear trace on each ULC authentication, clear trace at beginning of each command
* fix: don't send (DESFire?) deselect command after authentication

Specify that we need TCP and not UDP connection (#828)

fix 'lf pcf7931 bruteforce' (bug reported in http://www.proxmark.org/forum/viewtopic.php?id=6490) (#824)

(and whitespace fixes)

start updating 'hf mfu' commands (#818)

* use PrintAndLogEx()
* fix some printouts
* some #include refactoring
* whitespace

add: Home (Pos1) and End key bindings in graph GUI (based on @mcd1992 change on RRG repo) (#823)

fix compiler warning in cmdhflegic.c (and whitespace fixes) (#826)

Add: new option 'd' in 'hf mf ekeyprn' to create dumpkeys.bin from emulator memory (#822)

(and whitespace fixes)

Update README.md

Merge pull request #817 from Fl0-0/Fix_typo_cmdlf

Fix typo lf config usage

Fix typo lf config usage

fix hf mf sim (#812)

* fix parity encryption (thanks to Eloff, http://www.proxmark.org/forum/viewtopic.php?id=6347)
* add support to simulate Mifare Mini, Mifare 2K and Mifare 4K
* change to standard LED handling (A: PM is working, B: reader is sending, C: tag is responding, D: HF field is on)
* NAK on unknown commands
* allow unencrypted HALT
* don't display messages during simulation (or we will miss next reader command)
* use DMA to receive reader command
* switch earlier from send to listen mode
* move ADC initializer to iso14443_setup
* remove remainders of incomplete Mifare 10Byte UID simulation
* show 'short' bytes (7Bits or 8Bits without parity) in 'hf list mf' and 'hf list 14a'
* whitespace